赵普复相以后，卢多逊颇为不安。《宋史.太宗本纪》记载:普复相，多逊益不自安。普屡讽多逊令引退，多逊贪权固位，不能自决。赵普并不想将卢多逊赶尽杀绝，暗示他隐退，但卢多逊贪恋权位，并不死心。他甚至还想东山再起，于是勾结宋太宗的弟弟，秦王赵廷美。这恰恰犯了宋太宗的大忌。

太宗大怒，下诏一列举他不忠的罪过，贬授为兵部尚书。第二天，把卢多逊交给目史审问，命令翰林学士承旨李防、学士启蒙、卫尉卿崔仁冀、膳部郎中知杂事滕中正一同审讯。案情审结，召文武常参官在朝堂集议，太子太师王溥等七十四人上奏议论说:“谨按兵部尚书卢多逊，身任宰相，心怀怨望，秘密派遗堂吏，勾结亲王，互通声气，咒诅君父，大逆不道，败坏纲纪，上负国家恩宠，下亏为臣之节，应当予以诛罚，以正法律。请把卢多逊交给有关部门处理，削夺一切官爵，依法诛斩。秦王廷美，也请同卢多逊一起做出处理，其他牵连犯罪的人，希望按法律惩治。”太宗下诏将其流放至崖州。

卢多逊聪明才智，学识渊博固然值得欣赏，但他不懂为官之道，却总喜欢特才傲物，耍小聪明，在存在隐患之时，又贪恋权位，不能做到及时身退，最终落得抄家流放的罪过。