熹宗看完此疏后下旨褒奖了杨涟，并再次下诏陈述了李选侍的罪过：

朕冲龄登极，开诚布公，不意外廷乃有谤语，轻听盗犯之讹传，酿成他日之实录，诚如科臣杨涟所奏者，朕不得不再申谕以释群疑。九月初一日，皇考宾天，诸臣入临毕，请朝见朕，李选侍阻朕于暖阁，司礼官固请，既许而后悔。又使李进忠请回者，至再至三。朕至乾清宫丹陛上，大臣扈从前导，选侍又使李进忠来牵朕衣，卿等亲见，当时景象，危乎安乎？当避宫乎？不当避宫乎？初一日朕至乾清宫，朝见选侍毕，恭送梓宫于仁智殿，选侍差人传朕，必欲再朝见方回，各官皆所亲见，明是威挟朕躬，垂帘听政之意。朕蒙皇考命依选侍，朕不住彼宫，饮食衣服，皆皇祖皇考所赐，每日仅往彼一见，因之怀恨，凌虐不堪。若避宫不早，则彼爪牙成列，盈虚在手，朕亦不知如何矣。既殴崩圣母，又每使宫眷王寿花等，时来探听，不许朕与圣母旧人通一语，朕之苦衷，外廷不能尽知，今停封以慰圣母之灵，奉养以尊皇考之意，该部亦可以仰体朕心矣。臣工私于李党，不顾大义，谕卿等知之，今后毋得植党背公，自生枝节！

圣旨下来后，御史王养浩等人，又上奏说“殴崩圣母”四个字，有伤先帝的盛德，不应该写进圣旨里，垂示后世。熹宗没有批复。

还有那些与贾继春同党的人，纷纷诋毁杨涟勾结王安，企图为自己加官授爵，杨涟气不过于是就辞官回乡了。

不久，贾继春出外巡查江西，并且驰奏自明心迹。熹宗降旨严厉责备，第二年又以贾继春擅造入井雉经等语，将其放归田里，永不再录用。后来魏忠贤专权，假托熹宗诏命封李选侍为康妃，不过这都是后话，我们后面再详细叙说。

唯有李可灼呈入红丸一案，在光宗刚刚驾崩的时候，已由方从哲拟诏赏给李可灼五十两白银。算是酬谢他送命的功劳。大臣们对此都颇有不满，议论纷纷，抱怨说，李可灼误下猛烈药剂，没有受到惩罚也就算了，为什么还要奖赏他？御史王安舜首先上奏极谏道：

医不三世，不服其药。先帝之脉，雄壮浮大，此三焦火动，面唇赤紫，满面火升，食粥烦躁，此满腹火结。宜清不宜助，明矣。红铅乃妇人经水，阴中之阳，纯火之精也，而以投于虚火燥热之症，几何不速之死乎？然医有不精，犹可借口，臣独恨其胆之大也。以中外危疑之日，而敢以无方无制之药，假言金丹，轻亦当治以庸医杀人之条，乃蒙殿下颁以赏格，臣谓不过借此一举，塞外廷之议论也。夫轻用药之罪固大，而轻荐庸医之罪亦不小，不知其为谬，犹可言也，以其为善而荐之，不可言也。伏乞殿下改赏为罪，彻底究办！

奏折中只说李可灼误诊，即便提到了推荐他的人，也没有指名道姓，没什么激烈的言辞。方从哲只好又改夺李可灼一年的俸禄。

熹宗即位后，御史郑宗周再次弹劾崔文升的罪状，方从哲又拟旨命司礼监查处，于是御史冯三元、焦源溥、郭如楚，给事中魏应嘉，太常卿曹珖，光禄少卿高攀龙，主事吕维祺交相弹劾崔文升、李可灼的罪状，并说：“方从哲徇私枉法，国法何在！”给事中惠世扬竟然还列出了方从哲的十大罪状，其中有三条是杀头大罪。

他在奏折中写道：

方从哲独相七年，妨贤病国，罪一；骄蹇无礼，失误哭临，罪二；梃击青宫，庇护奸党，罪三；恣行凶臆，破坏丝纶，罪四；纵子杀人，蔑视宪典，罪五；阻抑言官，蔽塞耳目，罪六；陷城失律，宽议抚臣，罪七；马上催战，覆没全师，罪八；徇私罔上，鼎铉贻羞，罪九；代营榷税，蠹国殃民，罪十。

贵妃求封后，举朝力争，从哲依违两可，当诛者一；选侍乃郑氏私人，从哲受其宫奴所盗美珠，欲封为贵妃，又听其久据乾清，当诛者二；崔文升用泄药，伤损先帝，廷臣交章言之，从哲拟为脱罪，李可灼进劫药，以致先帝驾崩，从哲反拟加赏，律以春秋大义，弑君之罪何辞，当诛者三。

如此尤任其当国，朝廷尚有法律耶？务乞明正典刑，以为玩法无君者戒！

读者诸君，你想方从哲还有人心，到了此时，还有什么脸面在朝执政？他当即上奏辞官，直到第六次上奏，熹宗才命他为中极殿大学士，赏了银币、蟒衣，允许他辞官。

方从哲辞官之后，崔文升、李可灼两人始终没有被加罪。御史焦源溥、傅宗龙、马逢皋、李希孔，光禄少卿高攀龙等人又先后弹劾崔文升、李可灼两人。

没过多久，礼部尚书孙慎行弹劾李可灼进献红丸一事，并说方从哲谋逆。未免有些夸大其词了。

李可灼进红药两丸，实原任大学士方从哲所进。夫可灼官非太医，红丸不知何药，乃敢突然进呈，昔许悼公饮世子药而卒，世子即自杀，春秋犹书之为弑，然则从哲宜何居？速引剑自裁，以谢先帝，义之上也。合门席藁以待司寇，义之次也。乃悍然不顾，至举朝共攻可灼，仅令罚俸，岂以己实荐灼，恐与同罪，可灼可爱，而先帝可忍乎？纵无弑之心，却有弑之事，欲辞弑之名，难免弑之实。即有百口，亦无能为天下万世解矣。陛下以臣言有当，乞将从哲大正肆放之罚，速严两观之诛，并将李可灼严加考问，置之极刑。若臣言无当，即以重典治臣，亦所甘受，虽死何辞！

这道奏折被呈上去后，熹宗下旨让群臣合议，大臣到了一百一十多人，都认为原奏说得对，想加罪给方从哲。只有刑部尚书黄克缵，御史王志道、徐景濂，给事中汪庆等人维护方从哲，方从哲也上奏反驳，为自己辩白，熹宗于是命内阁大臣再次商议。

大学士韩爌、吏部尚书张问达、户部尚书汪应蛟等人详细写了红丸案的始末，大意是说：“李可灼自己申请献药，是先帝召问了他，并命他尽快制药，不但方从哲制止不了，臣等也没能阻止，所以现在方从哲坐罪，臣等也应该连坐。只是方从哲一开始赏赐李可灼，后来又罚了他的俸禄，论罪太轻，无法安抚人心，皇上应该将方从哲夺官。至于李可灼，他罪不至死，崔文升先进献凉药，罪过比李可灼更重，应该予以重罚，以泄公愤。”熹宗于是下旨将李可灼发配戍边，崔文升流放南京，方从哲不予以加罪。

孙慎行见公论难平，只好告病回乡。

后来尚宝司少卿刘志选反过来弹劾孙慎行诬陷先帝和皇上，熹宗于是将李可灼释放了。熹宗为何出尔反尔呢？原来，熹宗即位以后宠信魏忠贤，李可灼、崔文升等人于是就向魏忠贤行贿，魏忠贤权势熏天，什么事他不能做主？何况只是赦免崔文升和李可灼？我听说当时有位道士作了这样一首歌：

委鬼当头立，茄花满地红。

顾名思义，委鬼二字，合起来就是魏字，可茄花二字又该如何解释呢？敬看下章。

移宫案和红丸案一直众说纷纭，直到明朝灭亡。但说李选侍是下一个武氏，李可灼有谋逆之心，未免也太过苛刻和偏激了。方从哲之过在于模棱两可，熹宗过分指责李选侍的过错，不留余地，对崔文升和李可灼的态度却不明确，先抓后放，如此昏聩，不值一提。