朝廷此时已经灭亡了两越国，越人勇之说：“越人的风俗，重视敬祀鬼神，他们在举行祭祀时，常常能够看到鬼魂，而且非常灵验。在以往，东瓯王敬祀鬼神，享寿达一百六十余岁。后来的人们怠慢鬼神，逐渐失去了鬼神的护佑，招致衰亡。”武帝诏令越人巫师在越地设立祝祠，设立如同坛场的祭台，用来祭祀上天、神仙、百鬼，仍然按照越人的习俗，以杀鸡来占卜。武帝相信，越人在祭祀时，用杀鸡来占卜，非常灵验，汉人中后来也采用这种方法。

公孙卿说：“仙人是能够看到的，只是皇上来去匆匆，因此才难以看到。陛下可以像在缑氏城一样，建立馆舍，里边放上干肉、枣脯，神仙来了，就会停留下来。而且仙人喜欢住在楼上。”武帝于是诏令在长安建造飞廉、桂馆，在甘泉宫建造益寿馆、延寿馆，派出卿大夫持符节，设置祭祀用具，等待仙人。在甘泉宫建造通天台，在台下面设置祭祀用具，用来招待降临的神仙。甘泉宫又修建了前殿，拓宽各个宫室。在夏天，有灵芝从甘泉殿的房内长出来。武帝此时已经堵塞住了黄河决口，又建造了通天台，似乎看到天上有灵光显现，于是下诏，大赦天下。

第二年（元封三年，公元前108年），汉军讨伐朝鲜。夏天，发生旱情。公孙卿又说：“在黄帝那个世代，封禅即会发生旱情，这是因为封禅时需要封土，当时干旱了三年。”武帝又下诏，说：“天旱，与封禅时的封土有关系吗？诏令天下祭祀灵星。”

第二年（元封四年，公元前107年），武帝在雍县郊祀五帝神，此时回中道已经修筑完毕，武帝随后向北巡幸，出萧关（今宁夏固原县东南），经过独鹿山、鸣泽，而后从西河郡返回，在巡幸经过河东郡时，祭祀了后土神。

第二年冬天（元封五年，公元前106年），武帝巡幸来到南郡（湖北江陵），到了江陵县后，再向东行。在潜县登上天柱山祭拜，天柱山号称南岳。而后再登船沿江而下，从浔阳县抵达枞阳县，途中经过彭蠡泽（鄱阳湖），祭拜当地的名山大川。再向北，抵达琅琊郡，继而巡幸来到海上。四月，来到奉高县，整修泰山上的封土。

当初，武帝在封禅泰山时，泰山的东北方，有古时候建造明堂的遗址，地势险峻，房子也不够宽敞。武帝要在奉高县修建明堂，不知道应该遵循怎样的规制。济南人公玉带献上黄帝时期的明堂图。明堂中间是一座殿堂，四面没有墙壁，以茅草覆盖屋顶，有流水从明堂的下面穿过，水环绕着宫垣，上面还修建有复道，明堂上边建有楼阁，从西南沿着复道进入楼阁，名字叫做昆仑道，天子从这里进入，祭拜上帝。武帝于是诏令奉高县在汶河上修建明堂，按照上古时的图样。这一年在整修封土时，同时在明堂上的楼阁里祭祀泰一神、五帝神，高皇帝的神位与泰一神、五帝神相对而设。在明堂下面的庭堂里祭祀后土神，用二十个太牢礼。天子从昆仑道进入，祭祀的仪式与郊祀时的仪式一样。祭拜完毕后，在明堂下面焚烧祭礼，献予神灵享用。武帝再次登上泰山，在山巅上秘密祭祀。在泰山下祭祀五帝神，按照已经安排好的祭祀礼仪祭祀，黄帝与赤帝同时祭祀，祭祀官员在旁边伺候。山上举火，山下呼应。而后返回甘泉宫，郊祀泰一庙。春天武帝来到汾阴县，祭祀后土神。

第二年（太初元年，公元前104年），武帝巡幸抵达泰山，于十一月甲子朔旦冬至日，在明堂里祭祀上帝，没有整修封土。祭祀的祝辞中说：“上天增授皇帝泰一神策，周而复始。皇帝敬拜泰一神。”而后向东巡幸至海上，考察将要入海的方士，还有访求神仙的术士。经过多次派遣术士虽然都不灵验，但还是要派遣，希望能够侥幸遇上神仙。十一月乙酉（廿二日），柏梁台发生火灾。十二月甲午朔（初一），武帝亲自在高里山上封禅（山东省泰安市西南），而后祭祀后土神。巡幸抵达渤海边，眺望祭拜蓬莱岛，希望能够看到神仙居住的地方。

武帝返回后，因为柏梁台火灾的缘故，在甘泉宫接受郡县送上来的计簿。公孙卿说：“黄帝建成青灵台后，第十二天即发生火灾，黄帝于是再建造明廷。明廷，就在甘泉。”方士中有很多人说古时候的帝王在甘泉建都。武帝后来又在甘泉宫接见诸侯王，于是在甘泉宫建造了诸侯王朝觐的官邸。越人勇之说：“越人的习俗，遇到火灾，重新建造的房屋，一定要更大，这样才能够厌胜火灾。”武帝于是又建造了建章宫，宫殿千门万户。前殿高过未央宫。东边是凤阙门，高二十余丈。西边是唐中池，虎圈达几十里广阔。北边挖掘出一个很大的池塘，池塘中间修建渐台，高约二十丈，池塘的名字称作太液池，池塘中间有蓬莱、方丈、瀛州、壶梁小岛，模仿海中的仙山，还雕刻了石龟、石鱼等海中动物。南边有玉堂宫、璧门宫，以雕刻的神鸟为装饰。修建神明台、井干楼，高达五十余丈，中间有辇道相连。

太初元年夏天，朝廷开始修改历法，以正月为岁首，服饰颜色尚黄，官员的印章更改为五字（汉是土德，土在五行中排序为五，因此官印改为五字。印文不足五字，以“之”字补充。），将纪元年号更改为太初元年。这一年，汉军向西域征讨大宛国，内地发生蝗灾。丁夫人、洛阳人虞初等人用方术诅咒匈奴、大宛。

太初二年（公元前103年），有关官员说雍县的五帝庙贡献的祭品没有煮熟，生肉不具备肉食的香味。武帝诏令祭祀官员准备献祭的烹具，用来烹煮食物，祭祀的牲畜按照五帝的颜色选配（如火胜金，祭祀赤帝时则用白色的牺牲），用雕刻的木马代替马驹。祭祀名山大川用的马驹，均用雕刻好的木马来代替。只是在皇帝亲自祭祀时，才用马驹，其他祭祀也照此办理。

太初三年（公元前102年），武帝向东巡幸至海上，考察寻访神仙的事情，没有一件事情办得成功。方士中有人说，上古时黄帝建造五座城，还建有十二座楼，用来在执期这个地方等候神仙，名字叫做迎年（也叫做祈年。祈求长寿的意思。）。武帝批准按照这种方法建造，名字改为明年（意思是明确用以益寿延年）。武帝亲自拜祭，献祭黄色的牛犊。

公玉带说：“黄帝虽然在泰山上封禅，可是黄帝的大臣风后、封巨、岐伯建议黄帝还要在东泰山上封（山东省沂源县以东），在凡山上禅（山东省昌乐县以南），这才符合祭拜神灵的要求，而后才得以不死。”武帝随即诏令准备祭祀的用具，到东泰山去，东泰山太矮小，与其名声不相符，武帝诏令祭祀官员礼拜一下，没有亲自封。继而诏令带上祭祀用的物品，返回泰山，按照五年之前的仪式整修封土，增加禅石闾山。石闾山，在泰山脚下的南边，方士说那里有仙人居住的闾巷，武帝于是又亲自封禅祭祀。

又过了五年（天汉三年，公元前98年），武帝再次来到泰山整修封土，返回时祭拜恒山（河北省曲阳县西北）。

又过了五年（太始三年，公元前94年），武帝再次来到泰山整修封土。向东抵达琅琊郡，在成山头上祭拜，登上芝罘山，而后登船巡游渤海，在延年楼祭祀八神（即上文的“迎年”）。又在交门宫祭祀神仙，似乎座位上有神仙在向武帝回拜。

又过了五年（征和四年，公元前89年），武帝再次整修泰山上的封土。向东巡游抵达东莱县，驾临大海边。这一年，雍县在晴天的时候响起霹雳，打了三次响雷，天上出现彩虹，气色苍黄，好像有飞鸟聚集在棫（yù）阳宫的南边，声闻四百里远。天上落下二块陨石，像黳（黳（yī）：黑色的玉石）石一样黑，有关官员认为这是吉祥的徵兆，武帝将黳石供奉在祖庙。那些到海上访求蓬莱岛的术士，还是没有结果，公孙卿只是以巨人的大脚印来搪塞。武帝求仙的心情，依然是魂牵梦绕，希望侥幸可以遇到神仙。

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