邯郸县以北下起了暴雨，雨后浓雾弥漫，水得不到及时地排泄，深者达数丈，淹死数千人。

立国将军孙建去世，王莽任命司命赵闳为立国将军。宁始将军戴参恢复原来的职务，南城将军廉丹改任为宁始将军。

王莽天凤三年（公元16年）二月乙酉，发生地震，天上下起了大雨、大雪，崤山以东的情况更为严重，雪深达一丈，竹子、柏树因为受灾严重而枯死。大司空王邑上书，说：“臣在任上八年，工作成绩不佳，司空职务形同虚设，现在又有地震发生。请求乞骸骨，退休回家。”王莽说：“地震分为地动、地震，地震者有害，地动者无害。《春秋》中也有地震的记载，《易经》坤辞中也有地动的记载，地动时，地面开裂、合拢，万物因此而产生。灾异的出现，有各自的原因。天地出现震动，以显示天威，以警戒予（朕）躬，公有什么责任呢，现在要求乞骸骨，退休回家，你这样做不是要让予难堪吗。派诸吏散骑司禄大卫修宁男爵传达予的旨意。”

王莽天凤三年五月，王莽又制定了官吏俸禄制度，王莽说：“予遭遇阳九厄运，一百零六年一遇的灾难周期，国家财政困难，用度不足，人民骚动，从公卿以下官员，一个月的俸禄只有二匹十緵（zōng）布，或者一匹丝帛。每当想起这些，予心中常会感觉悲凉。现在厄运、灾难周期已经过去，国库虽然还没有充裕，也略有盈余，从六月初一庚寅开始，按照制度发给官吏俸禄。”从朝中的四辅、公卿、士大夫，到普通官员，分为十五等。最低官员的俸禄，一年为六十六斛，按照级别递增，最上等的到四辅，为一年一万斛。王莽又说：“‘普天之下，莫非王土；率土之宾，莫非王臣。’官吏需要天下的资财来供养。《周礼》中有膳食、珍馐美味一百二十种，现在诸侯的俸禄来源，都是享用封同、封国、封则；辟爵、任爵、附城（附庸）的俸禄来自于食邑；公、卿、大夫、元士的俸禄来自于采邑。多少不等，都有制度规定。一年的收成好，要向朝廷贡献礼物，收成不好，要有所减少，与百姓同喜、同忧。每年向朝廷上缴计簿时，进行统计，如果当年的收成没有遇到灾害，太官贡献的珍馐美味，按照规定，可以多享受一些；如果遇到荒年，按百分之十的比例递减。东岳太师和立国将军负责东方的三州（豫州、徐州、青州）一部二十五个郡；南岳太傅和前将军负责南方的二州（扬州、荆州）一部二十五个郡；西岳国师和宁始将军负责西方的二州（梁州、雍州）一部二十五个郡；北岳国将和卫将军负责北方的二州（冀州、兖州）一部二十五个郡；大司马负责纳卿、言卿、仕卿、作卿、京尉、扶尉、兆队、右队、中部、左部到前部，共有十个郡；大司徒负责乐卿、典卿、宗卿、秩卿、翼尉、光尉、左队、前队、中部、右部，共有五个郡；大司空负责予卿、虞卿、龚卿、工卿、师尉、列尉、祈队、后队、中部还有后部，共有十个郡；以及六司，六卿，所属的公爵，按照该地区的灾害，按照一年的丰歉情况，按照百分之十的比例递减俸禄。郎官、从官、京城的官吏俸禄，在京城的国库中支取，以太官供应的膳食品质作为标准，加以增减调节。诸侯、辟爵、任爵、附城（附庸）、官吏要关注当地的灾害，以及当地的粮食收成。只有这样，才能使得上下同心，才能促进农业发展，让百姓过上丰衣足食的生活。”王莽制订的制度如此繁琐，以至于每年地方郡县在上缴计簿时，很难保证有准确的统计，官吏也始终难以拿到制度规定的全额俸禄，于是官员之间更加肆无忌惮地贿赂公行，相互间收取财物，中饱私囊。

王莽天凤三年五月戊辰日，长平馆旁边的泾水西岸出现崩塌，堵塞了泾河水向下流动，河堤最终决口，大水向北边漫出。王莽派出大司空王邑前去巡查，回来后报告，朝中群臣向王莽敬酒祝贺，说这是《河图》中所讲的：“以土镇水。”是匈奴将要灭亡的徵兆。王莽于是派出并州牧宋弘、游击都尉任萌率领军队进攻匈奴，大军来到边郡后，随即驻留下来。

王莽天凤三年七月辛酉，霸城门遭遇火灾，这是民间所称的青门。

王莽天凤三年七月戊子是一个月中的最后一天，天上出现日食。王莽大赦天下。王莽又诏令朝中的公卿、大夫、诸侯、二千石官员举荐四种品行优秀的人才（有德行、通政事、能言语、明文学）每一种人才举荐一人。大司马陈茂因为天上出现日食，遭到罢免，武建伯严尤担任大司马。

王莽天凤三年十月戊辰，王路朱雀门无端地发出呜响，昼夜不停，崔发等人上奏，说：“虞舜帝开启四门，以打通四方的谏言。朱雀门鸣响，是在表明应当继承先圣的制度，招徕四方士人。”王莽于是诏令群臣祝贺，举荐的四种士人从朱雀门进入，来到朝廷回答策问。

平蛮将军冯茂进攻句町，带去的士卒有很多人患上疾病，为此而死去的士卒达十分之七；地方官府收取赋敛，达到百姓家中财产的十分之五；益州因此而民生凋敝，战事久拖不决。王莽将冯茂调回，逮捕下狱，此后死在狱中。王莽又派出宁始将军廉丹和庸州牧史熊进攻句町，颇有斩获，大军征剿取得初步胜利。王莽又想召回廉丹、史熊，廉丹、史熊要求增加军队和物资，决心将蛮夷彻底剿灭后，再奉诏班师。王莽同意增加赋敛，就都（广汉郡）的大尹冯英不肯增加百姓的赋敛，上奏朝廷，说：“自从越嶲郡遂久县的仇牛蛮夷、同亭郡（牂柯郡）的邪豆蛮夷反叛以来，前后经历十几年，郡县征剿一直没有停止过。此前任命冯茂率领军队征剿，可谓是不择手段，也采取了一些权宜措施。在僰道以南，那里的山高沟险，冯茂将蛮夷驱赶至荒无人烟的地方，化费了上亿计的军费，官兵因为瘴气患病而死的，达十分之七。现在廉丹和史熊担心按期不能完成征剿任务，强行向各郡县征调兵源、钱谷，为此而搜刮百姓手中的财物，强取豪夺达到百姓家产的十分之四，梁州因此而破败，战事仍迟迟不能结束。奏请朝廷将大军撤回，让留守的军队就地屯田，而后以鼓励奖赏的政策，招降叛乱的蛮夷。”王莽读了奏书后大怒，免去冯英的职务。又过了一段时间，王莽感觉到奏书中还有些合理成分，于是说：“冯英的话也无可厚非。”又任命冯英为长沙郡连帅。

与翟义一起谋反的同党王孙庆被抓获，王莽派出太医、药师和屠夫将王孙庆解剖，将王孙庆尸体的五脏六腑详细测量，用竹枝贯通血管、脉络，通过这些来了解人体构造，以及脉理、血管的走向，说这样做可以了解治病的原理。

王莽天凤三年，王莽派出大使五威将军王骏、西域都护李崇率领戊己校尉统辖的屯田军队出使西域，西域各国来到郊外欢迎使节，贡献礼物。西域国家因为此前杀害了西域都护但钦，王骏要借机报仇，遂安排突袭这些西域国王，王莽命令佐帅何封、戊己校尉郭钦率领军队分路出击。焉耆国诈降，在半路上伏击王骏等人，王骏等人遭到伏击后被杀。郭钦、何封随后赶到，将焉耆国留下来的老弱妇孺斩杀殆尽，而后从车师国撤军入塞。王莽任命郭钦为镇外将军，封郭钦为剿胡子爵，封何封为集胡男爵。从此后，西域与内地断绝联系。