青龙年间，山阳公去世，山阳公就是原先的汉献帝。王肃上疏说：“过去唐尧禅让给虞舜，虞舜禅让给夏禹；虞舜、夏禹都是在为退位君主服丧三年之后，才登上天子的尊位的。因此皇帝的称号既没有亏损，君臣的礼仪也仍然存在。现今山阳公承受并顺应天命，同意满足民众的愿望；把帝位禅让给大魏，自己退处宾客的位置。山阳公奉事魏朝，不敢不尽礼节；魏朝对待山阳公，优厚尊崇不把他当做臣僚。到了山阳公去世，棺木和衣物的规格，仪仗队伍的装饰，都与天子相同；因此远近肯定魏朝的仁慈，认为是伟大美好的安排。再说汉朝把帝和皇两个称号结合起来，称为皇帝。有特殊区别时称为帝，没有特殊区别时称为皇，可见皇这一称号是分量较轻的了。所以在汉高祖的时候，从道理上说国土上不能有两个君主；而他的父亲又还健在，于是就称他的父亲为皇，以表明不是有两个君主并存。何况现在是用来赠送给已死的人，可以称山阳公为皇，以和他的谥号相配。”

明帝没有听从称山阳公为皇的建议，追谥山阳公为汉孝献皇帝。

后来王肃以散骑常侍的身份兼任秘书监，又兼任崇文观祭酒。

景初年间，大规模修建皇宫，民众无法从事农业生产，官方征调人民服劳役时，许定的期限到了却不兑现，死刑判决仓促草率。王肃上疏说：“大魏承继前代帝王极度衰落的基础，人民所剩无几，战火蔓延未熄，实在是应该使人民休息，让他们都得到恩惠，从而安定远近四方的时候。要想蓄积财物而使疲倦的百姓得以休息，在于省减徭役而努力耕种。现今宫殿没有修好，工程没有完成；由水路调运粮物，需要层层辗转运输供应。因此，服劳役的壮丁辛苦劳作，疲惫不堪，农民离开了他们的田地；种粮的人很少，吃粮的人很多；旧粮已经没有了，新粮却无法接续。这是一个国家的最大忧患，而不是防备意外的好办法。修建皇宫的现有劳工已有三四万人。已完工的九龙殿可以安顿陛下圣体，它的里面足以排列六宫后妃；显阳殿也将要完工；只有太极殿以前的工程还很浩大。现今天气即将转入酷寒，疾病时有发生。确实希望陛下发出仁德的声音，颁布英明的诏令，深深怜悯劳工们的疲惫辛劳，多多同情百万民众的困乏不足；最好在那些一直吃皇粮而又没有紧急任务的士兵当中，选择壮年男丁，留下一万人来使用；使他们服劳役满一年就得到替换。这样，都知道休息替代有固定的日期，就没有人不高兴地做工，虽劳累而不怨恨了。合计一年有三百六十万个工作日，也不算少了。按原计划应当一年完成的工程，且让它三年完成。其余的劳力一律遣返，让他们都从事农业生产，这是使国家不会穷困的计划。仓库有满溢出来的粮食，民众有多余的劳力：用这些来建立功业，有什么功业不能建立呢？用这些来推行教化，有什么教化不能成功呢？取信于民，是一个国家最宝贵的东西。孔子说：‘自古以来人都要死掉，民众如果不信任，国家是立不起来的。’小小的晋国，小小的晋国公子重耳；想要使用他的人民，就先让大家看到他的信用；虽然原国军队将要投降，但是重耳顾守信用仍然撤军退回：所以他能只打一仗就开始称霸，至今还被人称道。前次陛下车驾要到洛阳，征调民工建立大营，官府许诺说大营建成就放他们回家。但是大营建成以后，又贪图使用这些民工，没有按时遣返。有关官员只知谋取眼前的利益，而不顾治理国家的规则。为臣认为，从今以后，如果再使用民间劳工，应该明确宣布命令，一定遵守规定期限；如果接着还有别的事情需要劳力，那就宁可再次征调，而不要丧失信用。另外，凡属陛下临时下令处以死刑的，都是些有罪的官员，应该处死的人。但是民众百姓不知道这种情况，认为过于仓促草率；所以希望陛下干脆把这种人交给司法官员审判而公开他们的罪行。衡量某人确实该处以死刑，也不要让他们死在宫廷里面而让远近的人们产生疑惑。而且人命最重要，生养人困难而杀死人容易，断了气就无法接续了，因此圣贤把这事看得很重。孟轲宣称：即使杀一个无辜的人能够获取天下，仁者也不愿做这样的事情。汉朝时有人冒犯皇帝车驾，使御马受惊，廷尉张释之上奏请求判处这人交纳罚金；汉文帝奇怪为什么罚得这么轻，而张释之却说：‘要是在事情发生的当时，圣上一怒之下把他杀了也就罢了。现在交给廷尉审判，廷尉是国家的天平啊！一旦倾斜，天下施用法律的人都可以随心所欲判轻判重，民众不就会手足无措了吗？’为臣认为他的话很没有道理，不是忠臣所应该说的话。廷尉，只是天子的吏员；如果他尚且不能丧失公平，难道以天子的身份，反而可以胡乱杀人吗？这种话只为自己着想，却很少为君主着想，是一种最不忠诚的行为！周公说：‘天子没有玩笑话；他的话，史官要记录，官吏要诵读，士人要提说。’说话尚且不能开玩笑，何况是行动呢？所以对张释之的话不可不明察，对周公的告诫不可不遵循啊。”

王肃又陈述：“皇家园林中各种鸟兽都是没有用的东西，饲养它们却有草料、粮食和人工等花费，为臣认为都可以去除。”

明帝曾经询问说：“汉桓帝时候，白马县令李云上书说：‘帝的意思就是谛（对政事的审察）。现在的情况却是皇帝想要不谛（对政事不审察）。’李云说了这样无礼的话怎么没有被处死？”

王肃回答说：“李云只不过是说话忘了态度应当恭顺；推究他本意，都是想要尽自己的忠心，念念不忘弥补国事的缺失。并且帝王的威势，比雷霆还要厉害；杀死一介匹夫，跟杀死一只蚂蚁没什么两样。宽容并且赦免李云这样的人，可以表明自己能够容纳接受恳切的言论，向天下人显示广大的德泽风度。所以臣下认为处死李云未必是正确的。”

明帝又询问说：“司马迁因为受了宫刑的缘故，内心怀有不满；写作《史记》时非议贬低汉武帝，令人切齿痛恨。”

王肃回答说：“司马迁记叙史事，不乱说好话，也不隐瞒过错。刘向、扬雄都佩服他善于叙事，具有优秀史官的才能，说他的《史记》是实事求是的记录。汉武帝听说他在写作《史记》，索取汉景帝和他自己的本纪阅览，看了大怒，把这些文字从木简上删削掉后又扔掉木简。到了今天这两篇本纪，也只有目录，而没有文字。司马迁后来遭遇李陵事件，被汉武帝下令关进蚕室处以宫刑。这样看来，不满是在汉武帝心中，而不在作《史记》的司马迁心中啊。”

正始元年（公元 240），王肃出京任广平郡太守。后因公务需要被征召回京，授官议郎。不久，任侍中。升为太常。当时大将军曹爽专权，任用何晏、邓飏等人。王肃与太尉蒋济、司农桓范谈论到时政，王肃严肃地说：“何、邓这类人也就是弘恭、石显之流，还提他们干什么！”曹爽知道了这话，告诫何晏等人说：“大家得小心！公卿们已把诸位比做前朝的恶人了。”王肃因宗庙祭祀上出现过错被免职。

后来他又出任光禄勋。当时有两条一尺长的鱼，出现在武器库房的屋顶上。有关官员认为是吉祥的事。王肃说：“鱼是生活在深渊里的，现在却高高显露在屋顶上，长有的鳞甲的动物丧失了居住的地方。边境上的将领难道将要有弃甲败逃的变故吗？”以后果然出现了东关战役的大败。王肃被调任河南尹。

嘉平六年（公元 254），王肃手持节杖，兼任太常，带领皇帝的礼仪车队，在元城迎接高贵乡公曹髦进京当皇帝。这一年，有白气一直贯通天空。大将军司马师，询问王肃是什么缘故，王肃回答说：“这叫做蚩尤的旗帜。东南方面难道将有动乱吗？您如果能修身以安定百姓，那么天下喜欢安定的人就会归附您，发动变乱的人先就会灭亡了。”

第二年春天，果然发生了镇东将军毌丘俭、扬州刺史文钦的反叛。司马师对王肃说：“霍光有感于夏侯胜的准确预言，开始重视儒学人士，实在是有原因的啊！请问您现今稳定国家，使君主得到安宁的办法在哪里呢？”王肃说：“当年关羽率领荆州的大军，在汉水边上降服了于禁，随即萌发了向北发展争夺天下的志向；后来孙权发动偷袭俘获了他将领士兵的家属，关羽的部队一下子就瓦解了。现在淮南将领士兵的父母妻儿，都在内地州郡居住；只要急速赶往淮南进行防御，不让叛军前进，那就一定会出现当年关羽那样土崩瓦解的局势了。”司马师听从了他的计策，果然打败了毌丘俭、文钦。后来王肃升为中领军，并兼任散骑常侍；增加封邑三百户，连同以前的共有二千二百户。

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